ГенБит: избранные публикации
2021, "Российская Федерация. Федеральная Служба по Интеллектуальной Собственности, Бюллетень № 14", Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к молекулярной диагностике, и может быть использовано в пищевой промышленности для матричной видовой идентификации рыб семейства тресковых (Gadidae) в пищевых продуктах и продовольственном сырье. Предлагаемый способ позволяет провести идентификацию всех видов тресковых рыб в рамках одного анализа и получить результат анализа быстрее по сравнению с существующими методами.
2019, "American Journal of Biometrics and Biostatistics". An approach to the exact quantitative analysis of seed traits without using reference material is proposed basing on the quantum (discreet) nature of seed distribution is seed lots. The approach has been proven theoretically and supported experimentally with the analysis of the presence of seeds of soybean lines A2704-12, A5547-127 and GTS 40-3-2 in seed lots with the use of PCR in real-time mode tracing the transformation events
2019, "Pathogens".The study is the first large-scale screening of a wide range of potato pathogens conducted in network mode using unified methodology and standardized qPCR micromatrices. The data represent valuable information for plant pathologists and potato producers and indicate the high potential of the combined use of matrix PCR technology and network approaches to data collection and analysis with the view to rapidly and accurately assess the prevalence of certain pathogens, as well as the phytosanitary state of large territories
2019, AIP Conference Proceedings. In this study we developed test system for real-time PCR detection and identification of Synchytrium endobioticum suitable for use in qPCR micromatrices providing for multiplex detection of a range of pathogens. The designed primers and probe were successfully tested for specificity on 10 samples of non-target fungal potato pathogens. Detection limit was 0.1 pg of DNA per reaction. Reproducibility assay showed the standard error for Ct value did not exceed 4.5%
2018, "Biosensors". In this study, diagnostic systems have been developed for simultaneous detection and identification of six fungal pathogens using 48-well microarrays (micromatrices) for qPCR. All oligonucleotide sets were tested for their specificity using 59 strains of target and non-target species. Detection limit of the developed test systems varied from 0.6 to 43.5 pg of DNA depending on target species with reproducibility within 0.3−0.7% (standard deviation)
2018, "Journal of Applied Microbiology". The method for highly sensitive, selective, rapid and easy‐to‐use detection and identification of economically significant potato pathogens, including viruses, bacteria and oomycetes, be it single pathogen, or a range of various pathogens that might occur simultaneously. The accurate, rapid and user‐friendly diagnostic system in a micromatrix format may significantly contribute to pathogen screening and phytopathological studies
2018, "Russian Journal of Nematology". Based on ITS1-5.8S-ITS2-28S rDNA sequences, test systems for detection of Ditylenchus destructor and D. dipsaci, and also for D. weischeri, a confounding species, were developed suitable for the use in complex qPCR micromatrices (microarrays) under standardised real-time PCR protocol.
2018, "Защита и Карантин Растений". Разработана новая тест-система для обнаружения и идентификации Spongospora subterranea с помощью ПЦР в режиме реального времени, а также проведена оценка её чувствительности, селективности и потенциального практического использования разработанного подхода.
2018, "Современные подходы и методы в защите растений", Был применен новый подход к диагностике патогенных микроорганизмов, основанный на использовании qPCR микроматриц (микрочипов), позволяющий проводить одновременное проведение 30-48 независимых реакций амплификации на одной матрице на микрочиповом амплификаторе AriaDNA
2017, "Russian Journal of Nematology". The easy, rapid and inexpensive system for the complex real-time multiplex PCR diagnostics of two potato cyst nematode species, Globodera rostochiensis and Globodera pallida, using disposable long-stored stationary PCR microarrays. Laboratory trials have demonstrated an excellent diagnostic efficiency and sensitivity of the developed test systems with the DNA detection limit equal to 1 and 10 pg for G. rostochiensis and G. pallida, respectively
2017, "Картофель и Овощи" ПЦР-диагностика в реальном времени на базе одноразовых ПЦР-матриц. В статье приведены результаты массового скрининга посадок картофеля в 11 регионах России при помощи ПЦР-матриц для одновременной диагностики 8 вирусных и вироидных патогенов картофеля – PVY (в т.ч. ординарной (PVYO) и некротической (PVYNTN) форм), PVX, PVM, PVS, PVA, PLRV, PMTV, PSTVd – в режиме реального времени
2016, "Biotechnologia Acta", Test-systems designed on the base of Desulfotomaculum, Desulfovibrio and Desulfobulbus genera sequences with their use in matrix real-time PCR provided for faster and more efficient identification of corrosive-relevant sulfate-reducing bacteria that conventional approaches do. This approach will serve as a base for monitoring of these bacteria for estimating corrosion sites
2015, "Биотехнология", В результате ПЦР с различными праймерами было показано, что яровой рапс сорта Раудис, позиционируемый как природно-устойчивый к глифосату и полученный традиционным методом селекции, является генно-инженерно модифицированным организмом, содержащим генетическую конструкцию, свойственную рапсу линии GT73 (Monsanto). С наличием данной конструкции, вероятно, связана подтвержденная экспериментально устойчивость сорта к глифосату
2015, "Защита и Карантин Растений. Приводятся результаты ~ 2500 испытаний растений картофеля иммунохроматографическим методом на тест-полосках (Lateral Flow Strip Test), проведённых в полевых условиях в нескольких регионах России